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Laboratorios virtuales

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Técnicas de laboratorio

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Incluye teoría y ejercicios sobre centrifugación, cromatografía, electroforesis, uso de isótopos, ensayos de unión de ligandos, cultivos celulares.

Practica los cálculos

Procedimientos básicos de cálculo en el laboratorio

mostrarFundamento de los cálculos de concentración en mezclas y diluciones.

Ejercicios de autoevaluación:

Cálculos aplicados a experimentos

Ensayos de cuantificación por espectrofotometría:

Simuladores

Cibertorio: laboratorio virtual de biología molecular

Acceso:

entrada Acceso al laboratorio virtual.

enlaceAnálisis de secuencias - Enlace directo a varias utilidades (transcripción-traducción, buscador de patrones de secuencia, manipulación de secuencias)

páginaInstrucciones generales sobre el uso de Cibertorio.

página“Iniciación al diagnóstico genético: una aproximación a la medicina molecular” J. C. Diez y A. Herráez (2017) RIECS 2 (1), 22-27. (Reseña sobre las aplicaciones docentes de Cibertorio)

páginaComentarios de usuarios.

Prestaciones:

Posibles aplicaciones:

Información previa:

Consulta también la bibliografía

Guiones de trabajo:

  1A 1B 1C 1D 2 3 4 5 6 7 8
utilizan electroforesis sí sí sí   sí sí sí sí sí sí sí
utilizan enzimas de restricción sí sí     sí         sí  
utilizan PCR         sí sí sí sí sí   sí

páginaInstrucciones generales sobre el uso de Cibertorio.

  1. Diagnóstico genético; polimorfismo βAS en el gen de globina beta, causante de la drepanocitosis y la anemia drepanocítica (anemia de células falciformes):
    1A pdf, doi:10.5281/zenodo.242576 Ensayo de enzimas de restricción para analizar este polimorfismo mediante RFLP. doi:10.5281/zenodo.791023
        mostrarGrupos de enzimas adecuados para la práctica.
        Preguntas de evaluación de los resultados:
    mostrarpara trabajo guiado (imprimir y rellenar y, posiblemente, entregar al profesor)
    mostrarpara trabajo autónomo (con autoevaluación).
    1B pdf Diagnóstico genético molecular del polimorfismo mediante RFLP. doi:10.5281/zenodo.790734
        Preguntas de evaluación de los resultados:
    mostrarpara trabajo guiado (imprimir y rellenar y, posiblemente, entregar al profesor)
    mostrarpara trabajo autónomo (con autoevaluación).
    1C pdf Secuenciación de DNA para analizar este polimorfismo (método de los didesoxinucleótidos). doi:10.5281/zenodo.791278
        Preguntas de evaluación de los resultados:
    mostrarpara trabajo guiado (imprimir y rellenar y, posiblemente, entregar al profesor)
    mostrarpara trabajo autónomo (con autoevaluación).
    1D pdf Introducción a las bases de datos de secuencia genómica y análisis de secuencias relacionadas con este polimorfismo. doi:10.5281/zenodo.790376
  2. Análisis forense: identificación genética de individuos:
    2A pdf, doi:10.5281/zenodo.242576 Ensayo empleando RFLP. doi:10.5281/zenodo.791674
    2B pdf Ensayo empleando PCR múltiplex sobre marcadores polimórficos STR (CoDIS). doi:10.5281/zenodo.2529358
  3. pdf Análisis de paternidad mediante ensayo de PCR múltiplex sobre marcadores polimórficos STR (CoDIS). https://doi.org/10.5281/zenodo.791819
  4. pdf Diagnóstico genético, medicina personalizada. Identificación de variantes polimórficas en el citocromo P450 (CYP2C9), mediante ensayo PCR múltiplex. doi:10.5281/zenodo.791265
  5. pdf Diagnóstico genético de celiaquía. Identificación de variantes polimórficas asociadas a la enfermedad celíaca, mediante ensayo PCR múltiplex sobre los marcadores DQ2 y DQ8. doi:10.5281/zenodo.790814
  6. pdf Análisis de productos lácteos. Identificación del origen de la leche (vaca, oveja o cabra) analizando DNA mitocondrial. doi:10.5281/zenodo.790805
  7. pdf Análisis de aceites vegetales. Identificación del origen de un aceite (oliva, soja, girasol, maíz, colza, palma, cacahuete) analizando DNA del cloroplasto. doi:10.5281/zenodo.3879435
  8. pdf Análisis de infección vírica. Identificación de la infección por coronavirus o por virus de la gripe común mediante ensayo PCR múltiplex sobre el cDNA obtenido a partir de las muestras. doi:10.5281/zenodo.3726354

Bibliografía:

Simulador de electroforesis de proteínas sobre acetato de celulosa

Acceso:

Acceso al simulador

entrada para proteínas séricas

entrada para isoenzimas LDH

entrada experimento virtual con isoenzimas LDH

Prestaciones:

Posibles aplicaciones:

Actividades de trabajo:

Simulador de electroforesis de proteínas en gel de poliacrilamida con SDS (SDS-PAGE)

Acceso:

entrada Acceso al simulador.

Prestaciones:

Posibles aplicaciones:

Guiones de trabajo:

Estos ejercicios están integrados en la página del simulador.

Laboratorios de espectrofotometría UV-VIS

Simulador de espectros de absorción ultravioleta de proteínas y ácidos nucleicos

Acceso:

entrada Acceso al simulador.

Prestaciones:

  • Espectro de absorción entre 230 y 340 nm de proteínas y DNA.
  • Valores de absorbancia a 260 y 280 nm, y cociente entre ambas.
  • Perfiles predefinidos: proteínas, DNA y cuatro mezclas de ejemplo.
  • Perfiles a petición en función de las proporciones de cada tipo de molécula que se indiquen.
  • Posibilidad de superponer espectros sucesivos para compararlos.

Aplicaciones:

  • Demostración del valor analítico de la técnica para evaluar la contaminación de DNA por proteínas o viceversa.

Espectrofotómetro virtual ultravioleta-visible

A) Espectros:

entrada Acceso al laboratorio virtual.

Prestaciones:

  • Preparación de diluciones.
  • Espectro de absorción de diversas sustancias entre 200 y 800 nm.
  • Ensayo de Bradford para proteínas.
  • Espectros de la hemoglobina y sus diversas formas (oxi, desoxi, carboxi, meta).

Aplicaciones:

  • Relación entre absorbancia y concentración.
  • Fundamento de un ensayo de cuantificación de proteínas.
  • Determinación de espectros de absorción; búsqueda de λmáx

B) Ensayos con curva patrón:

entrada Acceso al laboratorio virtual.

Prestaciones:

  • Determinación de la concentración de glucosa.
  • Ensayo de Lowry para proteínas.
  • Determinación de creatinina.

Aplicaciones:

  • Experimentos virtuales de tipo analítico con ensayo colorimétrico a punto final.

C) Ensayos cinéticos:

entrada Acceso al laboratorio virtual.

Prestaciones:

  • Determinación de la actividad gamma-glutamiltranspeptidasa.

Aplicaciones:

  • Experimentos virtuales de tipo analítico con ensayo colorimétrico a lo largo del tiempo.

Otros ensayos colorimétricos

Determinación de cuerpos cetónicos

entrada Acceso al laboratorio virtual.

Prestaciones:

  • Ensayo semicuantitativo sobre tiras reactivas.
  • La intensidad de color obtenida depende de la concentración de acetoacetato en las muestras.

Aplicaciones:

  • Diagnóstico de diabetes.

Ensayo del MTT para viabilidad metabólica

entrada Acceso al laboratorio virtual.

Prestaciones:

  • Ensayo de actividad deshidrogenasa como medida de viabilidad metabólica celular, empleando una placa de 24 pocillos con células adherentes.

Aplicaciones:

  • Ensayo de citotoxicidad.

Ensayo colorimétrico de actividad enzimática

Acceso:

entrada Acceso al laboratorio virtual.

Prestaciones:

  • Ensayo de actividad enzimática.
  • Efecto del pH y la temperatura sobre la actividad de una enzima.

Aplicaciones:

  • Búsqueda de las condiciones óptimas para la enzima.

Simulador de espectros de dicroísmo circular de proteínas

Acceso:

entrada Acceso al simulador.

Prestaciones:

Posibles aplicaciones:

Simuladores de cromatografía

Cromatografía de proteínas en columna

entrada Acceso al simulador.

Prestaciones:

Posibles aplicaciones:

Guiones de trabajo:

Cromatografía de intercambio iónico en columna para determinar hemoglobina glicada

entrada Acceso al simulador.

Prestaciones:

Cromatografía en capa fina para análisis de mezclas de aminoácidos o lípidos

entrada Experimento virtual con aminoácidos.

entrada Experimento virtual con lípidos.

Prestaciones:

En proyecto:

Si estás interesado en colaborar en la construcción de alguno de estos laboratorios virtuales, o aportar ideas para nuevos guiones, envía un mensaje electrónico.