17.3 RNA polimerasas en procariotas
Identidad
En procariotas y en orgánulos subcelulares de eucariotas (mitocondrias y cloroplastos) se utiliza una sola RNA polimerasa para sintetizar todos los RNA (mRNA, tRNA y rRNA). En las bacterias hay unas 3000 moléculas de la RNApol; en cada momento la mitad de ellas se encuentran implicadas en la transcripción. Esta enzima añade alrededor de 30 nt/s, con una tasa de error de 1 en 105 y elevada procesividad.
Genes que transcribe
A diferencia de eucariotas, la misma polimerasa se encarga de transcribir todos los genes.
Inhibición
La actividad de la RNApol bacteriana no se ve afectada por la amanitina (lo que la diferencia de las RNApol eucarióticas). Sí la inhiben otros diversos compuestos, que por ello se emplean como antibióticos (pág. 272).
Estructura
La RNApol de varias especies bacterianas (E. coli y T. aquaticus entre ellas) está formada por 5 polipéptidos, asociados formando la llamada “enzima mínima” o “enzima núcleo”. Para iniciar la transcripción, la enzima mínima requiere la unión de otro polipéptido independiente, la subunidad o factor σ, que participa reconociendo las secuencias promotoras en el DNA, o sitios de inicio de la transcripción. Una vez iniciada la transcripción, la subunidad σ se disocia de la enzima mínima, que continúa elongando el RNA.
| α (36,5 kDa) | ensambla la enzima mínima y se une a proteínas reguladoras |  |
enzima "núcleo" o "mínima" (390 kDa) |
|
holoenzima |
|---|---|---|---|---|---|
| β (151 kDa) | polimerasa (sitio catalítico) | ||||
| β′ (155 kDa) | se une al DNA molde | ||||
| ω (11 kDa) | al parecer, estabiliza el complejo | ||||
| σ (70 kDa) | especificidad por secuencias de inicio: reconoce al promotor e inicia la síntesis | ||||
El papel de la subunidad σ es, pues, análogo al de los factores de transcripción generales en los eucariotas (pág. 287).
Referencias
- Estructuras de la RNApol de la bacteria Thermus aquaticus obtenidas mediante difracción de rayos X (1HQM.pdb y 1L9U.pdb) doi:10.2210/pdb1hqm/pdb y doi:10.2210/pdb1l9u/pdb