En procariotas, esta transición se desencadena por la disociación de la subunidad σ de la holoenzima RNApol, quedando aquélla disponible para su interacción con una nueva RNApol mínima e iniciar la transcripción en un nuevo promotor. El resto de la polimerasa (RNApol mínima, desprovista de la subunidad σ) continúa actuando en la elongación.