Biomodel-1: complementos visuales informáticos para Bioquímica y para Biología Molecular e Ingeniería Genética (nivel universitario)

Ácidos nucleicos, proteínas y sus interacciones mutuas.

Versión con JSmol.
Compatible con todos los navegadores modernos .

Biomodel-2: más complementos visuales informáticos para Bioquímica

El mundo de los lípidos.
Estructura y propiedades de lípidos.

Modelo de bicapa lipídica: colesterol, fosfolípidos, bicapa y canal de gramicidina.
Compatible con todos los navegadores modernos .

Biomodel-2 se incluyó (en español y en inglés) en BioMolecular Explorer 3D, version 2, un sitio web y CD-ROM “diseñado para proporcionar a los profesores de biología en enseñanza secundaria un fácil acceso a estructuras tridimensionales interactivas de moléculas biológicamente relevantes”.

Biomodel-3: complementos visuales informáticos para bioquímica en enseñanza secundaria

Versión simplificada. Incluye la estructura tridimensional de algunos ejemplos de glúcidos, lípidos, vitaminas, aminoácidos, péptidos, proteínas, nucleótidos y ácidos nucleicos.

Compatible con todos los navegadores modernos .

Biomodel-3 recibió un tercer premio en el concurso 2006 del Ministerio de Educación y Ciencia de España para materiales educativos curriculares en soporte electrónico que puedan ser utilizados y difundidos en internet.

Biomodel-3 se incluyó (en español y en inglés) en BioMolecular Explorer 3D, version 2, un sitio web y CD-ROM “diseñado para proporcionar a los profesores de biología en enseñanza secundaria un fácil acceso a estructuras tridimensionales interactivas de moléculas biológicamente relevantes”.

Biomodel-4: estructura del DNA

Guía para el estudio mediante la investigación autónoma.

Compatible con todos los navegadores modernos .

Biomodel-4 se incluyó (en español y en inglés) en BioMolecular Explorer 3D, version 2, un sitio web y CD-ROM “diseñado para proporcionar a los profesores de biología en enseñanza secundaria un fácil acceso a estructuras tridimensionales interactivas de moléculas biológicamente relevantes”.

   Esta guía para la estructura del DNA está disponible en español, inglés, portugués, francés, alemán, italiano, rumano, polaco, turco y chino.

Biomodel-5: biopolímeros

Material complementario y otras biomoléculas menos habituales.

Compatible con todos los navegadores modernos .

Proyecto Genoma Humano

Citogenética: el estudio de los cromosomas

Información general de citogenética: Morfología de los cromosomas, cariotipo, análisis cromosómico, anomalías cromosómicas, estudio citogenético por tinción de bandas y por fluorescencia (técnica FISH).
   ( Por cortesía de  Dave McDonald  y  Dynagene Cytogenetics Laboratory )

Citogenética clínica: Introducción a la Citogenética y análisis cromosómico. Cariotipo, tipos de bandeado, FISH. Anomalías cromosómicas. Múltiples fotos y dibujos animados de cariotipos anormales.
   ( Por cortesía de   Marshall Horwitz, University of Washington School of Medicine )

Genes, cromosomas y meiosis: Definiciones y figuras (genotipo, fenotipo, gen, alelo, cromosoma, cromátida). El proceso de meiosis: figuras y dibujo animado; meiosis I y II.
   ( Por cortesía de   Marshall Horwitz, University of Washington School of Medicine )

Genética del cáncer: Oncogenes, genes oncosupresores y genes "mutadores" (genes de reparación o del ciclo celular)
   ( Por cortesía de   Marshall Horwitz, University of Washington School of Medicine )

Código genético

Esquemas animados de técnicas y procesos bioquímicos

Estructura: 

Agua y tampones. Carbohidratos. Proteínas. DNA. Membranas.

Procesos: 

Enzimas. Metabolismo. Transporte intracelular. Replicación. Transcripción. Maduración del RNA. Traducción. Maduración de proteínas. Procesos celulares.

Técnicas: 

Centrifugación. Cromatografía. Electroforesis. Hibridación. DNA recombinado.

Estereoisomería de biomoléculas

(Autoevaluación interactiva con modelos tridimensionales)

• Isomería óptica: enantiómeros, nomenclatura R-S, fórmulas de proyección de Fischer, diastereómeros.
• Monosacáridos: nomenclaturas D-L y R-S, fórmulas de Fischer, de Newman, de Haworth, nomenclatura alfa-beta.
• Disacáridos y polisacáridos.
• Aminoácidos y péptidos

Compatible con todos los navegadores modernos .

Páginas en español de «El Proyecto Biológico» (originado en la Universidad de Arizona)

Versión local en español de las secciones

• Bioquímica (completa)
• Biología Molecular (completa)
• Biología Humana ("ADN en medicina legal")

Traductores: Angel Herráez, Mª Cristina Tejedor y Pilar Sancho (UAH), Isabel Carrero (UVa), Jesús Salgado (UV).

Estudio de los ácidos nucleicos

Análisis electroforético de DNA plasmídico

(Comentario guiado)

• Plásmidos, su superenrollamiento y su análisis mediante electroforesis.
• Digestión parcial de un plásmido usando enzimas de restricción y análisis electroforético.
• Interpretación de los geles e introducción a la elaboración de un mapa de restricción.

Superenrollamiento del DNA

(Módulo de aprendizaje activo, nivel medio y avanzado)

y enlaces cruzados a material dentro de otras secciones de Biomodel.

Estructura del agua: enlaces de hidrógeno

Enlaces en el agua y en el hielo.

Simulación de la condensación de moléculas de agua en una gotícula.

Simulación de la transición agua-hielo.

Incluye un modelo molecular animado, generado mediante minimización energética.

Este módulo (v.1) se incluyó (en español y en inglés) en BioMolecular Explorer 3D, version 2, un sitio web y CD-ROM “diseñado para proporcionar a los profesores de biología en enseñanza secundaria un fácil acceso a estructuras tridimensionales interactivas de moléculas biológicamente relevantes”.

Temas diversos

Radiactividad, ácido-base y oxidorreducción

Contenidos de los temas en forma de presentación, acompañados de actividades y ejercicios.

Elaborado en colaboración con la Universidad Nacional del Nordeste (Corrientes, Argentina)

Aplicaciones químicas

Brico-moléculas: dibuja tu estructura y consigue el modelo tridimensional.

Incluye "Consigue estructuras tridimensionales a partir del nombre"

Laboratorios virtuales

Simuladores de técnicas de laboratorio

• Ejercicios de autoevaluación sobre procedimientos básicos de cálculo en el laboratorio: diluciones, conversión de unidades, absorbancia y concentración.
• Simuladores de electroforesis
  • de proteínas en gel de poliacrilamida con SDS (SDS-PAGE)
  • de proteínas séricas sobre acetato de celulosa
  • de isoenzimas de LDH sobre acetato de celulosa
  • de DNA en gel de agarosa
  • de DNA en gel de poliacrilamida para secuenciación
• Laboratorio virtual de biología molecular
  • digestión de DNA con enzimas de restricción
  • análisis electroforético de los fragmentos
  • secuenciación de DNA por el método de didesoxinucleótidos
• Simulador de espectros
  • de absorción ultravioleta de mezclas de proteínas y DNA
  • de dicroísmo circular de proteínas, en función de su estructura secundaria

Metabolismo

Materiales diversos para ilustrar algunos aspectos del metabolismo.

Ejercicios de autoevaluación

1) de estereoisomería: véase más arriba

2) véase también “El Proyecto Biológico”

3) Preguntas, ejercicios y problemas, con respuestas y comentarios, elaborados para las antiguas asignaturas: Biología Molecular e Ingeniería Genética y Bioquímica Clínica y Patología Molecular Humana (de la Licenciatura en Farmacia en la Universidad de Alcalá)

Colección de enlaces para bioquímica y biología molecular

Enlaces a páginas web útiles para la enseñanza y el aprendizaje de la Bioquímica y Biología Molecular.
(Esta colección de enlaces es una parte del proyecto BioROM)

Protein Explorer en español

Potente programa de uso sencillo para investigar la estructura de macromoléculas. Copyright © 2004 Eric Martz, traducido al español por Gabriel Pons ().

Ideas para el futuro:

Proteínas gigantes

Estructura de glúcidos

... ¿Alguna sugerencia?