La desaminación oxidativa de la citosina (pág. 302 y 391) la convierte en uracilo, lo que termina introduciendo un cambio de G por A; aunque los sistemas de reparación de errores actúen corrigiendo el U, si lo hacen después de que haya tenido lugar una replicación, la mutación quedará fijada: el par CG pasará a ser un par TA.
La desaminación oxidativa de la adenina (pág. 302 y 391) la convierte en hipoxantina (esta misma transformación puede ser también el resultado de una hidrólisis ácida). La hipoxantina empareja con citosina (o, más correctamente, se emparejan sus nucleósidos inosina y citidina respectivamente). Como resultado, tras la replicación y aunque se corrija la hipoxantina, aparece un par CG donde había un TA.
desaminación tras replicación tras replicación
Las formas tautoméricas menos abundantes establecen puentes de hidrógeno diferentes. Por ejemplo, la forma imina de la adenina empareja mejor con citosina. Una vez incorporada ésta, queda fijada la mutación TA→CG aunque más tarde la adenina revierta a la forma amina.
tautomería tras replicación tras replicación
La rotura del enlace N-glicosídico con una purina deja un sitio abásico (apurínico, pág. 392). De no ser corregido, en la replicación siguiente es probable que se omita esa posición, generando la deleción de un par de bases AT.
despurinación tras replicación
La metilación de la guanina por agentes químicos (pág. 393) conduce a O6-metilguanina, que no empareja con citosina, sino con timina. Aunque se elimine más tarde el grupo metilo, la replicación fija la mutación CG→TA.
metilación tras replicación tras replicación
De forma análoga afecta la metilación de la timina a O4-metiltimina, que se empareja con guanina.
metilación tras replicación tras replicación
La adición de bromodesoxiuridina a células en cultivo es una técnica habitual para marcar el DNA y medir la proliferación celular; el fundamento es la analogía estructural de este nucleósido con la timidina. Aparte de esto, el bromouracilo tiene mayor facilidad para adoptar la forma enol que la timidina y la uridina, y dicha forma enol empareja mejor con guanina, introduciendo así mutaciones TA→CG.