18.5 Diferentes promotores y factores de transcripción usados por la RNApol III

La RNApolIII, que es la más grande de las RNA polimerasas eucarióticas, transcribe varios genes, todos ellos de moléculas pequeñas de RNA funcionales (<400 nt) que no codifican proteínas.

Algunos de ellos son:

• RNA pequeños que actúan en la regulación de la transcripción: el RNA 7SK, los microRNA denominados “del tipo Alu”.
• RNA pequeños que actúan en la maduraión postranscripcional: el snRNA U6, el componente de la RNasa P, el de la RNasa MRP.
• RNA pequeños que actúan en la traducción: el rRNA 5S y todos los tRNA.

Para iniciar la transcripción, la RNApolIII requiere promotores y TF diferentes dependiendo del gen. Estos se agrupan en tres categorías:

Promotores del tipo 1

A este tipo pertenece únicamente el gen de rRNA 5S.

Secuencias promotoras:

• Caja A: situada aprox. entre +50 y +65. Se encuentra en la región codificante del gen, por lo que se trata de una región interna de control (ICR).
• Caja C: aprox. entre +80 y +99. Igualmente es una ICR.
• Hay, además, una tercera región entre ambas, el "elemento intermedio".

Factores de transcripción:

• TFIIIA, una proteína de 42 kDa con 9 dedos de zinc.
• TFIIIB, variante β, formado por 3 subunidades: TBP, Brf1 y Bdp1 (que pueden verse como factores de tipo III asociados a TBP, o TAF_III).
  TBP es la misma proteína que forma parte de los TFIID y SL1 (que es un TFI), aunque aquí no reconoce el promotor, pues no hay caja TATA.
• TFIIIC, formado por 6 subunidades organizadas en 2 dominios conectados por un tramo flexible (de 520 a 600 kDa en total).

1) El factor de transcripción TFIIIA se une al DNA en las cajas A y C y elemento intermedio.

2) TFIIIA atrae al otro factor, TFIIIC.

3) El complejo de factor TFIIIA y factor TFIIIC permite la fijación sobre el DNA dal factor TFIIIB.

4) Con el complejo de preiniciación ya completo, TFIIIB atrae y sitúa la polimerasa y así comienza la transcripción.

Promotores del tipo 2

En este grupo se encuentran los promotores de los genes de tRNA, entre otros.

Secuencias promotoras:

• Caja A: situada aprox. entre +8 y +19, con secuencia TGGCNNACGTGG. Se encuentra en la región codificante del gen, por lo que se trata de una región interna de control (ICR). Concretamente, además de actuar como secuencia promotora, codifica el bucle D del tRNA .
• Caja B: aprox. entre +45 y +62, con secuencia GGTTCGANNCC. Es igualmente una ICR y en este caso codifica el bucle TΨC.
• (No hay caja C)

Factores de transcripción:

• TFIIIB, variante β, el mismo que se une a los promotores del tipo 1. De nuevo, al no haber caja TATA, sólo se ubica sobre el DNA gracias al factor C.
• TFIIIC (véase arriba)

1) El TFIIIC se une directamente al DNA en las cajas A y B; su estructura flexible le permite unirse a cajas B que se encuentran separadas de la A por distancias diversas dependiendo del gen.

2) El TFIIIB se une al TFIIIC, quedando así ubicado en la posición correcta del DNA, cadena arriba del punto de inicio.

3) La RNApol se une al factor B y comienza la transcripción.

Promotores del tipo 3

Se incluye aquí el promotor del gen de uno de los RNA nucleares pequeños que intervienen en el ayuste, el snRNA U6, entre otros. La organización de estos promotores es diversa según especies; se indican aquí las características en el gen snRNA U6 humano.

Secuencias promotoras:

• Caja TATA: situada aprox. entre −32 y −25.
• PSE aprox. entre −66 y −46.
• DSE situada alrededor de −225.

A diferencia de los dos tipos anteriores, estos promotores no son intragénicos —no presentan IRC— sino que se encuentran cadena arriba del gen (hacia 5´).

Factores de transcripción:

• TFIIIB, variante α, formado por 3 subunidades: TBP, Brf2 y Bdp1 (que pueden verse como factores de tipo III asociados a TBP, o TAF_III).
• SNAPc (con 5 subunidades, también conocido como PBP o PTF) , que se une al promotor proximal PSE.
• Factores, como Oct-1 y Staf, que se unen al promotor distal DSE.

1) Los factores distales y el factor proximal SNAPc colaboran en la unión del factor TFIIIB sobre la caja TATA, quedando así ubicado en la posición correcta del DNA, cadena arriba del punto de inicio.

2) La RNApol se une al factor TFIIIB y comienza la transcripción.