Ventaja: específico y rápido, pues sólo requiere un paso.
Inconveniente: para cada tipo de célula que se desea separar es preciso preparar su anticuerpo magnético específico.
Ventaja: los reactivos magnéticos son comunes para todos los antígenos.
Inconveniente: necesita varias etapas.
Mezcla de distintos tipos celulares: muestra
1. Se añaden las microesferas
1a. Se añade el anticuerpo primario
1b. Se añaden las microesferas
(Puede consultar más información sobre el sistema biotina-estreptavidina.)
2. Muestra procedente de la etapa 1
3. Separación mediante un imán
(Válido igualmente para el método indirecto)
Método similar aplicado a la extracción de ácidos nucleicos.