Os tRNAs ou RNAs de transferência são moléculas de filamento simples que adoptam um dobramento ou estrutura tridimensional característica, em forma de L.
(A estrutura secundária que dá lugar a este dobramento ou estrutura terciária é a chamada folha de trevo )

Como se observa, existem umas regiões onde a molécula adopta uma dupla hélice intracadeia. Isto acontece devido a  formação de pontes de hidrogénio entre bases complementares de duas zonas da mesma cadeia:

MOSTRAR

OCULTAR

	Bases emparelhadas
	Bases  não emparelhadas

Estas ligações provocam que se adopte o dobramento tridimensional, proporcionando a  molécula a sua estrutura tridimensional característica.

As zonas emparelhadas definem quatro braços ou asas na estrutura do tRNA; ordenados de 5' a 3' são:

Braço aceptor do aminoácido
Braço D ou DHU
Braço do anticodão
Braço T ou TYC

Cada braço tem uma região emparelhada, ou caule (stem), e outra não emparelhada no seu extremo, ou laço(loop).

Ademais dos 4 braços, existe outra região, de comprimento variável, que pode ou não emparelhar as suas bases: o Braço variável. 

Vistas axiais ao longo dos dois braços da "L":
(Deter antes a rotação)

sobre o eixo do braço aceptor (com o extremo 5' em primeiro plano, e o 3' um bocado mais atrás)

sobre o eixo do braço do anticodão (com o anticodão em primeiro plano)

Sobre o modelo espacial compacto vejamos algumas zonas funcionalmente importantes da molécula:

Esqueleto

Bases

Nucleotídeo do extremo 5' :

Esqueleto

Base

Nucleotídeo do extremo 3' :

Esqueleto

Base

Anticodão :

Esqueleto

Bases

Voltemos a representação simplificada. O exemplo que temos visto corresponde ao tRNA da levedura específico para fenilalanina (tRNA^Phe).
Vejamos outro exemplo, no qual o braço variável (zona grossa) é maior: (tRNA^Ser da levedura).
(sobre esta molécula os botões de ocultar e mostrar bases não actuarão correctamente)