Exemplo
1: Três motivos dedo
de zinco consecutivos numa mesma
cadeia peptídica, ligados ao DNA.
Fragmento (resíduos aminoácidos 1-101) do factor
de transcrição TFIIIA, da rã Xenopus laevis, ligado
ao 15 pb do gene para RNA 5S.
A estrutura que é comum as outras proteínas, e por isto se chama motivo, está constituída neste caso dum segmento peptídico em alfa-hélice e dois em folha beta antiparalela, dos quais há 4 aminoácidos (2 Cys e 2 His) cujas cadeias laterais coordenam ao ião Zn2+; este tipo de dedo de zinco e então nomeado C2H2. Se destacam os átomos que coordenam ao Zn (N em His e S em Cys).
Exemplo
2: Seis motivos dedo
de zinco C2H2
consecutivos numa mesma cadeia peptídica.
Da mesma proteína, TFIIIA.
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Exemplo
3: Outro tipo de motivo dedo
de zinco.
Receptor de estrogénios humano, ligado ao DNA.
Neste caso, a proteína possui só um dedo de zinco
mas forma um dímero
ao se ligar ao DNA
Ademais,
o motivo tem uma estrutura diferente: 2 iões
Zn2+, coordenados cada um por uma hélice
e um bucle, a través das cadeias laterais de 4 cisteínas
para
cada ião Zn.
Este tipo de domínio se chama dedo de zinco C4.
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