Rencana Pengajaran Struktur DNA untuk Guru

• Kumpulkan siswa dalam suatu laboratorium komputer di mana setiap pasang siswa (atau setiap siswa) memiliki sebuah perangkat komputer. Kami merekomendasikan agar siswa bekerja berpasang-pasangan.
• Bagikan pertanyaan yang sudah dicetak. Tentukan pertanyaan nomor berapa saja yang harus dikerjakan oleh siswa, dan berapa banyak waktu yang mereka butuhkan. Membuat siswa bekerja berpasangan lebih baik. Anda boleh menginstruksika siswa untuk melewati pertanyaan yang membingungkan. Jelaskan bahwa mereka perlu menggunakan grafik molekuler interaktif untuk membantu menjawab pertanyaan.
• Setelah waktu yang ditentukan, bagikan kunci jawabannya, dan persilahkan setiap orang memeriksa jawaban pasangan mereka. Perkenankan diskusi antara kedua anggota.

Peringatan:

Pertanyaan 17 (dalam Set B) hanya dapat diartikan dan dijawab ketika aplikasi tutorial menggunakan salah satu dari kedua model DNA yang tersedia untuk tutorial ini. Penyusun web atau pengajar dapat memilih model manakah yang ditampilkan, dengan edisi salah satu file atau mengunjungi server yang berbeda. Penjelasan lebih lanjut.

Jawaban untuk pertanyaan-pertanyaan tersedia bagi para tenaga pendidik dengan bertanya melalui surat elektronik (email) kepada Eric Martz, dengan menunjukkan bukti jabatan pendidik mereka, seperti referensi dari sekolah/universitas atau daftar guru di sekolah/universitas.

[ Kembali ke halaman utama ]

(Penjelasan lanjutan)

Memilih model DNA untuk digunakan

Terdapat dua model DNA alternatif yang disediakan dalam tutorial ini. Anda dapat memeriksa model manakah yang sedang digunakan dengan membuka menu pop-up di Jmol (klik-kanan, atau klik pada logo Jmol di pojok kanan-bawah layar) dan melihat pada entri paling atas, yang menampilkan antara 1D66 atau dna.

(a) Model klasik 1d66-pwz.pdb (dimodifikasi oleh Eric Martz daru 1d66.pdb, untuk tutorial DNA lama yang menggunakan Chime).

Model ini memiliki kesalahan pada C28, di mana basanya terbalik sehingga sisi yang menghadap G11 komplementer adalah sisi yang salah.

Menggunakan kemampuan Jmol, ikatan hidrogen yang panjang tergambar ke arah atom-atom yang sesuai, yakni C28 dan G11, yang terletak jauh terpisah dalam model; sehingga didapatkan ikatan hidrogen yang terlalu panjang, sebagaimana yang tergambar secara otomatis oleh aplikasi Chime.

Eric Martz memanfaatkan anomali ini untuk membuat salah satu pertanyaan bagi siswa (soal #17).

(b) Model dna.pdb yang baru (dimodifikasi by Angel Herráez dari 1d66-pwz.pdb) dengan posisi C28 yang telah diperbaiki, yang membentuk ikatan hidrogen Watson-Crick yang sesuai di Jmol.

Pertanyaan siswa #17 tidak masuk akal dalam model ini dan tidak dapat dijawab.