HIV - SIDA: Glycoprotéine d'enveloppe virale gp120 complexée avec l'antigène CD4 et un anticorps
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La gp120 est aussi liée avec un anticorps neutralisant (induit) (17b).
Cette structure montre la partie extracellulaire de la gp120 (bleu
foncé) du HIV liée à la partie extracellulaire de l'antigène CD4 (bleu clair) située à la surface d'un lymphocyte T ou d'un macrophage. Est également présent un anticorps neutralisant la gp120 du HIV (chaîne légère en vert et chaîne lourde en orange). Les chaînes d'anticorps peuvent être masquées avec ces boutons: chaîne lourde
chaîne légère
Vous pouvez faire tourner la molécule avec la souris (bouton gauche enfoncé) ou en utilisant les boutons situés au bas de cette page.
Interactions entre molécule gp120 et antigène CD4 :
L'antigène CD4 situé à la surface de la cellule et la gp120 du virus interagissent au niveau d'une dépression dans la molécule de gp120 dépourvue de chaînes carbonées (chaînes carbonées en “volume” ). Les contacts directs entre les deux protéines impliquent 22 acides aminés du CD4 et 26 acides aminés de la gp120 mais les résidus qui sont les plus importants dans cette association sont Trp427, Glu370, Gly473 et Ile371 du gp120 (volume ) qui interagissent avec Phe43 du CD4 (volume ), et Val430 du gp120 (volume ) qui interagit avec Arg59 du CD4 (volume ). Faites un sur cette zone (et ). Vous pouvez aussi afficher les acides aminés et les chaînes carbonées en mode "space-fill" à l'aide des boutons situés à la droite de la molécule.
Interactions entre gp120 et récepteur de chimiokines (molécules permettant le recrutement des cellules immunitaires) :
En plus de son interaction avec l'antigène CD4 à la surface des lymphocytes T4, la gp120 peut aussi réagir avec un co-récepteur. Il existe de très nombreux récepteurs de chimiokines capables de réagir avec la gp120. Le site de liaison pour la chimiokine apparaît après la liaison avec l'antigène CD4. Ce site recouvre en partie la chaîne lourde de l'anticorps sur cette image (chaîne lourde en “volume” ). Les résidus de la gp120 impliqués dans cette liaison sont Lys121, Arg419, Lys 421 et Gln422 (volume ). Notez également que cette interaction a lieu une fois de plus dans une région dépourvue de chaiînes carbonées (volume ). Vous pouvez aussi sélectionner le mode “volume” pour chaque acide aminé en uilisant les boutons ci-dessous.
Pour effectuer d'autres modifications : utilisez le clic droit sur la molécule pour faire apparaître le menu “Jmol”.
Vous pouvez aussi observer la structure de la molécule de gp120 avec plus de détails en vous rendant ici (en anglais).
Informations sur la base de données PDB : ici. Version in English.
Consulter la page originale (en anglais) : http://www.med.sc.edu:85/chime2/hiv-cd-ab-buttons.htm
© Richard Hunt, University of South Carolina School of Medicine.
Traduction française J-P. Chouzenoux.
Adapté à
Jmol par Angel Herráez, Universidad de Alcalá, Espagne.