Instalación de archivos de Jmol en el servidor web

Dado que la funcionalidad de Jmol depende de un objecto HTML5 o una miniaplicación Java y del lenguaje JavaScript, es sencillo instalar en un servidor web páginas que contienen objetos Jmol. Estas instrucciones se han desarrollado en un servidor que utiliza Apache, y es posible que no funcionen correctamente para un servidor Microsoft (si alguien tiene acceso a este tipo de servidor, agradeceré que me comunique el resultado). Si usas un sistema de gestión de contenidos (CMS) es posible que estas instrucciones no sirvan, pues la mayoría de instalaciones de CMS limitan la inclusión de ciertos tipos de archivos o de instrucciones JavaScript. Además, en muchos sistemas CMS es difícil subir una carpeta de archivos completa. Dentro del equipo de desarrollo de Jmol se está trabajando en la forma de insertar Jmol en wikis (consulta la wiki de Jmol si quieres más información). Si no sabes cómo añadir contenidos a tu servidor web, deberías comentarlo con el administrador de tu web antes de intentar la instalación de Jmol o de páginas que utilicen Jmol.

Necesitarás subir una serie de archivos a tu servidor web. La mejor manera de hacerlo es mediante una conexión ftp o sftp.
Entre los programas que puedes usar para la transferencia de archivos se pueden citar:

1. Sube los archivos de Jmol indicados más abajo a un sitio adecuado del servidor, que habitualmente será cerca de la raíz de la estructura de carpetas o directorios a la que tengas acceso. Sólo es preciso hacer esto una vez, así como cuando quieras actualizar la versión de Jmol. Cerciórate de dónde estás colocando la carpeta de Jmol, pues tendrás que especificar su ruta en las páginas web que crees.

   Archivos y carpetas necesarios (se sugiere ponerlos todos en una carpeta jsmol):

   • archivo JSmol.min.js
   • carpeta idioma con todo su contenido
   • carpeta java con todo su contenido
   • carpeta j2s con todo su contenido
   • carpeta php con todo su contenido

2. Sube la carpeta que contiene tu página web (no solo sus contenidos, sino la carpeta completa) a una ubicación en la estructura de carpetas del servidor de modo que la ruta hacia Jmol que hayas especificado en tus páginas sea correcta. Aunque es posible usar otras ubicaciones, se recomienda ésta:
   • carpeta jsmol
     • contiene todos los archivos de Jmol indicados más arriba
   • carpeta de la página (a la misma altura que la anterior)
     • contiene los archivos de los modelos moleculares (.mol, .pdb), el archivo .html que se grabó con el nombre que escogiste, así como una serie de archivos (.png, .js, .spt) que generó el módulo "Exportar a Web"