16.6a Estructura de fluorocromos (ampliación)

fluoresceína

Numeración de la molécula

Formas en equilibrio (pH bajo pH elevado)

• FAM, 5- o 6-carboxifluoresceína
• FITC, 5- o 6-isotiocianato de fluoresceína
• JOE, 5- o 6-carboxi-diclorodimetoxifluoresceína
• TET, 5- o 6-carboxi-tetraclorofluoresceína
• HEX, 5- o 6-carboxi-hexaclorofluoresceína

Rodamina es realmente un nombre genérico para una familia de compuestos con un núcleo estructural común.

• Ejemplo: rodamina 123.

• Derivados metilados:
  • TMR, tetrametilrodamina
  • TAMRA, 5- o 6-carboxi-tetrametilrodamina
  • TRITC, 5- o 6-isotiocianato de tetrametilrodamina
• Derivados etilados:
  • rodamina 6G
  • rodamina B
  • rojo rodamina
• Otros derivados:
  • rodamina 101
  • ROX, 5- o 6-carboxi-X-rodamina
  • sulforrodamina 101
    • TR, rojo Texas

Cianina es un término genérico para una familia de fluorocromos sintéticos derivados del polimetino.

Núcleo estructural:
Cy3 Cy5 Cy3.5 Cy5.5

Ejemplos:
un derivado Cy3 activado como fosforamidita para reaccionar con grupos –OH
un derivado Cy3 distinto, activado como éster de N-hidroxisuccinimida (NHS) para reaccionar con grupos –NH₂

Derivados de boro-dipirrometeno.

Numeración de la molécula

BODIPY FL
BODIPY R6G
BODIPY TMR
BODIPY 581/591
BODIPY TR
BODIPY 630/650
BODIPY 650/665