.
Por ejemplo, un aumento de temperatura reduce la torsión
y un aumento de fuerza iónica puede aumentarla. Otro factor importante
es la presencia de los denominados agentes intercalantes,
moléculas planas e hidrófobas que se insertan entre los pares
de bases apilados de la doble hélice, por lo común forzando
ésta a una apertura, un desenrollamiento parcial, una reducción
de la torsión.
Bromuro de etidio |
El sistema aromático de anillos condensados es responsable del
intercalamiento. Su unión reduce localmente la torsión de
la doble hélice en aprox. 26°, lo que habitualmente se compensa
con un aumento del retorcimiento(superenrollamiento
negativo). Por otro lado, la fluorescencia propia del bromuro de etidio aumenta mucho al unirse al DNA. Por esta razón, se utiliza habitualmente para detectar la posición del DNA en los geles de electroforesis
("teñir las bandas de DNA"). |
Amsacrina |
Sinónimos: m-AMSA, amsacrine, amsidine, amsine, 4'-(9-acridinilamino)-3'-metoximetanosulfonanilida El intercalante es el anillo de acridina; el anillo de metanosulfonanilida
se sitúa en el surco menor Es inhibidor de la topoisomerasa II. |
Cloroquina |
Se utiliza a menudo en estudios de superenrollamiento de plásmidos.
Además, es uno de los fármacos clásicos para el tratamiento
de la malaria (nombres comerciales Nivaquine®, Aralen®,
Resochin®, Avloclor®), aunque su principal
mecanismo de acción no depende de su capacidad intercalante. |
Naranja de acridina |
Agente intercalante, inhibe la transcripción
. Se utiliza también para teñir el DNA en geles de electroforesis
o en células completas (citometría de flujo).
Al unirse al DNA emite fluorescencia intensa (de color verde, en contraste
con su nombre). |
Daunomicina y derivados |
Agentes intercalantes, se utilizan en quimioterapia contra el cáncer (inhiben la transcripción, afectando más a las células de crecimiento rápido). |
Otros compuestos se unen al DNA aumentando la torsión de la doble hélice (apretando la hélice) y, por tanto, inducen un superenrollamiento positivo:
Netropsina |
Es un antibiótico natural, con actividad antitumoral y antiviral. Se une al surco menor de la doble hélice, preferentemente en zonas ricas en AT. Como resultado, la doble hélice se aprieta (aumenta su torsión). |
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