5.8 Estructura de los motivos hélice-bucle-hélice

(HLH, helix-loop-helix)

Vemos aquí un dímero de la proteína Max del ratón (un factor de transcripción, pág. 284 ), unido al DNA. Esta proteína posee un motivo HLH a través del cual se une al DNA.

Cada cadena se muestra en un color: las 2 hebras de DNA y 2 motivos en la  proteína dimérica.

la estructura que es común con otras proteínas, y por ello se llama motivo; éste consta de:

1. un tramo en hélice alfa, que encaja en el surco mayor del DNA e interacciona directamente con las bases nitrogenadas, llamado por ello hélice de reconocimiento (similar al presente en el motivo hélice-giro-hélice);
2. un tramo de péptido sin estructura secundaria, más largo y flexible que en el motivo hélice-giro-hélice, llamado por ello un bucle (en inglés loop);
3. otra hélice alfa que no interacciona con el DNA pero sí con la otra cadena proteica, estabilizando el dímero.

Ejercicio: tras los motivos, identifique cada parte de la molécula y señale el color con el que se ha representado en el modelo:

	Hélice de reconocimiento	(Pulse sobre un recuadro coloreado para asignar ese color al elemento descrito a su derecha) Cuando acabe, verifique sus respuestas
	Bucle
	Hélice de dimerización

Estos tres componentes dan nombre al motivo. Además de ellos, cada proteína en particular posee otras regiones que forman el resto de la molécula, no mostradas.

El estrecho contacto entre proteína y DNA se aprecia mejor al el modelo con todos sus átomos en esferas.

Referencias:

• Estructura del dominio ligante de DNA de la proteína Max, en complejo con el DNA diana (1AN2.pdb) doi:10.2210/pdb1an2/pdb