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Modelo de bicamada lipídica e canal de gramicidina
Incluído no "Índice Mundial de Recursos de Visualização Molecular" ( World Index of Molecular Visualization Resources ).
Lipid Bilayers and the Gramicidin Channel -- in English.

Este material é uma versão antiga. A não ser que tenhas boas razões para o usar, em general se recomenda que uses a versão actualizada que usa Jmol.

Esta apresentação precisa de Netscape 4.08-4.76. É possível que NÃO funcione correctamente em Netscape 6-7 ou em Internet Explorer. 

Podes ver moléculas rotando nos cantos superiores desta página? Se vês  no seu lugar, significa que não tens instalado Chime. Não poderás ver a bicamada lipídica se não tens instalado o conector ou plug-in Chime. Descarrega o instalador de Chime. Se tiver problemas, consulta aqui (em inglês).

   Ao contrário de outras páginas de apresentação de modelos moleculares, esta não deve-se percorrer em qualquer ordem; só funciona correctamente se se carregar os botões  na ordem em que aparecem. Por outra parte, mesmo que o usuário pode mover as moléculas ou mudar a sua forma de representação utilizando o rato e o menu emergente de Chime, isto alterará o resto da apresentação.
Se tem assinalado assim os botões que se podem utilizar como 
pontos de inicio para restaurar a sequência correcta de apresentação.

   Em consequência, é recomendável que a primeira visita se limite a  carregar todos os botões,  um em um e por ordem, observando o modelo, e só depois  começar a experimentar com o movimento manual do modelo ou a utilização dos botões noutra ordem.
   Também se pode utilizar o programa Protein Explorer para rotar, ampliar, reduzir, mudar as cores e a forma de representação destas moléculas (ligações a Protein Explorer mais em baixo).

Para ir a cada uma das seguintes secções, carrega o botão "Começar a Apresentação" e depois a ligação "Página Seguinte" até chegar a secção desejada.
Secções:
  • Colesterol
  • Fosfolípido
  • Bicamada lipídica
  • Canal de gramicidina
Esta apresentação pode descarregar-se para seu uso sem conexão a internet.

Para explorar as moléculas desta apresentação em Protein Explorer (em inglês): 
Colesterol
Fosfatidilcolina (PC)
20 PC's em modelo cristalino de monocamada
40 PC's em modelo cristalino de bicamada, hidratada		 bicamada de PC hidratada: 
modelo cristalino
modelo em gel
modelo fluído		 Canal de gramicidina em bicamada de PE, hidratada

   Este formato em página web utilizando Chime é © 2001 de  (Depto. Bioquímica e Biologia Molecular, Universidade de Alcalá, 28871 Alcalá de Henares, Espanha).
   Desenvolvido e traduzido a partir dum script para Rasmol, © 1997  (Dept. Microbiology, University of Massachusetts, Amherst, MA 01003-5720, U.S.A.).
   Se permitem a utilização e a copia com fins educativos não comerciais. O uso comercial exige um acordo prévio com os autores.

   Inclui uma simulação mediante dinâmica molecular da bicamada de fosfatidilcolina em água, realizada por H. Heller, M. Schaefer e K. Schulten no Theoretical Biophysics Group, Beckmann Institute, University of Illinois, Urbana-Champaign, U.S.A. ("Molecular dynamics simulation of a bilayer of 200 lipids in the gel and in the liquid-crystal phases", J. Phys. Chem. 97:8343-60, 1993).
   Inclui também uma simulação por dinâmica molecular da gramicidina numa bicamada, realizada por  , T.B. Woolf y  em CENG, Centre d'Etudes Atomiques, Grenoble, Francia, y Chemistry Dept., Université de Montreal, Montreal H3C 3J7 Canadá. ("A molecular dynamics  study of gating in dioxolane-linked gramicidin A channels", Biophys. J. 67:1370-86, 1994).

   Mais modelos moleculares que utilizam Chime, em espanhol, em Biomodel: http://www.uah.es/otrosweb/biomodel

   Há outros recursos com Chime em espanhol no "Índice Mundial de Recursos de Visualização Molecular" ( World Index of Molecular Visualization Resources ). 


Versão Biomodel-2v0 - abril2001 -- maio 2004 em português