IgG Anti-Lisozima:
Complexo Fab:Lisozima

Neste exemplo se mostra a união dum fragmento Fab da IgG anti-lisozima com uma molécula de lisozima.
Cadeia H, Cadeia L, Antigénio (Lisozima)

Se só for apresentado o esqueleto peptídico (com os pontes disulfetos) se tornam mais evidentes no fragmento Fab os domínios variável e constante das cadeias pesadas e leves. Lembre que o domínio variável é aquele que tem o sitio de união para o antigénio.

Em cada uma das regiões variáveis (domínios H_V e L_V ha três Regiões Hipervariáveis ou regiões onde a variação de aminoácidos entre as IgG que se ligam a diferentes antigénios é máxima.
Estas regiões também se nomeiam Regiões Determinantes da Complementaridade (CDR).

Nas regiões CDR se encontram os átomos do anticorpo que contactam com o  antigénio (Lisozima).

Neste esquema se mostra o esqueleto peptídico da Lisozima (de amino a carboxilo terminal). Os resíduos que contactam com o anticorpo (epítopo) se mostram em traço grosso.

Finalmente, neste modelo compacto se mostra:

1. O complexo Fab-Lisozima (identificados os átomos dos CDR e do Epítopo).
2. O fragmento Fab (identificados os átomos dos CDR)
3. A Lisozima (identificados os átomos do Epítopo).