La N se usa para indicar «cualquier nucleótido»,
es decir, que o bien no se sabe qué nucleótido ocupa esa posición de la secuencia, o bien es indiferente cuál sea.
Otras abreviaturas (acordes con la recomendación IUB):
| R | purina (A o G) |
| Y | pirimidina (C o T; pyrimidine en inglés) |
| W | A o T (de weak, débil, pues estas bases establecen sólo dos enlaces de H) |
| S | G o C (de strong, fuerte, pues estas bases establecen tres enlaces de H) |
| M | A o C (de amino , pues ambas tienen este grupo en posiciones similares) |
| K | G o T (de keto, ceto, pues ambas tienen este grupo en posiciones similares) |
| H | A, C o T (cualquiera excepto G; por orden alfabético, tras G viene H) |
| B | G, C o T (cualquiera excepto A; por orden alfabético, tras A viene B) |
| V | A, C o G (cualquiera excepto T; por orden alfabético, tras T viene U, pero es uridina, así que queda V) |
| D | A, G o T (cualquiera excepto C; por orden alfabético, tras C viene D) |