Algunas propiedades de los aminoácidos proteinogénicos

Nombres y abreviaturas normalizadas

Las filas de la tabla se pueden reordenar alfabéticamente pulsando en la cabecera de cada una de las columnas.

Estas abreviaturas son las recomendadas por IUPAC e IUBMB [1, 2]

Se han coloreado las abreviaturas de una letra que no coinciden con la inicial de las 3 letras.

*Otros nombres habituales:

nombre abrev.3 abrev.1
glicina Gly G
alanina Ala A
valina Val V
leucina Leu L
isoleucina Ile I
prolina Pro P
fenilalanina Phe F
tirosina Tyr Y
triptófano Trp W
serina Ser S
treonina Thr T
cisteína Cys C
metionina Met M
selenocisteína Sec U
aspartato * Asp D
glutamato * Glu E
asparagina * Asn N
glutamina Gln Q
lisina Lys K
arginina Arg R
histidina His H
pirrolisina Pyl O
    B
    J
(genérico,
no especificado
o desconocido) 		Xaa X
    Z

Tamaño

Comparación de tamaño y masa molecular de cada aminoácido:

tamaño
masa
  175 147 132 132 146
  146 155 115 181 204
  105 119 75 89 149
168 121 165 131 117 131
nombre abrev. masa
molecular
glicina Gly 75
alanina Ala 89
valina Val 117
leucina Leu 131
isoleucina Ile 131
prolina Pro 115
fenilalanina Phe 165
tirosina Tyr 181
triptófano Trp 204
serina Ser 105
treonina Thr 119
asparagina Asn 132
glutamina Gln 146
cisteína Cys 121
metionina Met 149
aspartato Asp 132
glutamato Glu 146
histidina His 155
lisina Lys 147
arginina Arg 175
selenocisteína Sec 167
pirrolisina Pyl 255

Las filas de la tabla se pueden reordenar de menor a mayor valor, y viceversa, pulsando en la cabecera de cada una de las columnas.

Presencia en los distintos tipos de estructura secundaria

nombre abrev. hélice
alfa		 hebra
beta		 giro
glicina Gly 0.43 0.58 1.77
alanina Ala 1.41 0.72 0.82
valina Val 0.90 1.87 0.41
leucina Leu 1.34 1.22 0.57
isoleucina Ile 1.09 1.67 0.47
prolina Pro 0.34 0.31 1.32
fenilalanina Phe 1.16 1.33 0.59
tirosina Tyr 0.74 1.45 0.76
triptófano Trp 1.02 1.35 0.65
serina Ser 0.57 0.96 1.22
treonina Thr 0.76 1.17 0.90
asparagina Asn 0.76 0.48 1.34
glutamina Gln 1.27 0.98 0.84
cisteína Cys 0.66 1.40 0.54
metionina Met 1.30 1.14 0.52
aspartato Asp 0.99 0.39 1.24
glutamato Glu 1.59 0.52 1.01
histidina His 1.05 0.80 0.81
lisina Lys 1.23 0.69 1.07
arginina Arg 1.21 0.84 0.90

En el conjunto de proteínas de estructura conocida se determinaron

  1. la frecuencia con la que cada aminoácido aparece formando parte de una hélice alfa, una hebra beta o un giro
  2. la frecuencia con la que cada aminoácido aparece en todo el conjunto de proteínas (abundancia del aminoácido)

El cociente a/b nos da una idea de la tendencia de cada aminoácido a formar parte de una u otra estructura secundaria, de lo cual interpretamos si la estabiliza o desestabiliza:

Las filas de la tabla se pueden reordenar de menor a mayor valor, y viceversa, pulsando en la cabecera de cada una de las columnas.

Fuente de los datos: Amino Acid Structure/Function. Charles S. Gasser (2010) Molecular and Cellular Biology, University of California, Davis. https://www.mcb.ucdavis.edu/courses/bis102/AAProp.html y https://www.mcb.ucdavis.edu/courses/bis102/Footnotes.html (consultado 5 sep. 2016)