Vemos el brazo del anticodón del tRNAPhe (el mismo estudiado anteriormente): Esqueleto (línea imaginaria que une los fosfatos). Tallo (nucleótidos con bases emparejadas). Bucle (nucleótidos con bases no emparejadas), excepto el anticodón (triplete mG-A-A) ( mG es O2'-metilguanosina-5'-monofosfato)
Ahora el modelo molecular de la interacción de este anticodón (mG-A-A en el tRNA) con un codón UUU (en el mRNA). Para diferenciarlos bien, se han coloreado los átomos de carbono del tRNA y los del mRNA.
(Puesto que el metilo de mG está en la pentosa, no afecta al emparejamiento y mG se empareja igual que G.) (El codón complementario sería UUC, pero gracias al balanceo también es posible el emparejamiento con UUU; a esto se le llama codones sinónimos, y ambos codifican Phe; una muestra de la degeneración del código genético.)
Observa los enlaces de hidrógeno entre las bases de codón y anticodón, así como su coplanariedad y enfrentamiento.