Una sola proteína (una cadena polipeptídica) se une al DNA mediante varios motivos dedo de zinc consecutivos.
La estructura que es común con otras proteínas, y por ello se llama motivo, consta en este caso de un segmento peptídico en hélice alfa y dos en hoja beta antiparalela, de los cuales hay 4 aminoácidos (2 Cys y 2 His) cuyas cadenas laterales coordinan al ion Zn2+; este tipo de dedo de zinc se denomina por ello C2H2. Se destacan los átomos que coordinan al Zn (N en His y S en Cys).
De nuevo, varios motivos dedo de zinc C2H2 consecutivos en una misma cadena polipeptídica.
Otro tipo de motivo dedo de zinc.
En este caso, la proteína posee un solo dedo de zinc pero forma un dímero al unirse al DNA.
Además, el motivo tiene una estructura diferente: 2 iones Zn2+, coordinados cada uno por una hélice y un bucle, a través de las cadenas laterales de 4 cisteínas para cada ion Zn. Este tipo de motivo se llama dedo de zinc C4.