Proteína GCN4 de levadura; se muestra sólo una parte de la proteína, la que corresponde al motivo cremallera de leucina, unida a un fragmento de DNA.
Cada cadena se muestra en un color: las 2 hebras de DNA y 2 cadenas en la proteína.
La estructura que es común con otras proteínas, y por ello se llama motivo, consta de los dos segmentos peptídicos en hélice alfa, que a su vez se arrollan ligeramente entre sí (formando una superhélice). En un extremo, estas hélices interaccionan entre sí y en el otro lo hacen con secuencias específicas de bases en el surco mayor del DNA.
para apreciar el arrollamiento mutuo de las dos cadenas proteicas helicoidales.
La interacción entre las dos hélices se mantiene principalmente gracias a la interacción entre cadenas laterales de leucina, situadas cada 7 residuos en la secuencia (2 vueltas de hélice alfa).
Por otro lado, en la región que contacta con el DNA existe abundancia de aminoácidos con carga positiva, como arginina.
Modelo espacial compacto
Vista ampliada de uno de los contactos entre leucinas de ambas cadenas (cadenas laterales en color más oscuro, otros aminoácidos en color CPK: CON).