Motivo homeodominio

Dímero de la proteína MAT alfa-2 de levadura, con dos homeodominios idénticos, unido a un fragmento de DNA de 21 pb.

Cada cadena se muestra en un color: las 2 hebras de DNA y 2 motivos en la proteína dimérica.

La estructura que es común con otras proteínas, y por ello se llama motivo, consta de:

  1. un motivo de tipo hélice-giro-hélice que contacta con el surco mayor del DNA (dos tramos en hélice alfa separados por un corto tramo sin estructura secundaria);
  2. una tercera hélice, externa al DNA;
  3. un tramo sin estructura secundaria definida que interacciona con el DNA en el surco menor.

Además, cada proteína en particular posee otras regiones que forman el resto de la molécula, no mostradas.

Ejercicio:

Identifica cada parte de la molécula y señala el color con el que se ha representado en el modelo:
(haz clic sobre un recuadro coloreado para asignar ese color al elemento que queda a su derecha)
Hélice de reconocimiento
—giro
—hélice
Tercera hélice
Contacto en el surco menor

Cuando acabes, pulsa

 


Obsérvese cómo las dos hélices de reconocimiento encajan en posiciones sucesivas del surco mayor.

Modelo espacial compacto, o de esferas.

en color más claro el péptido que contacta con el surco menor.

Otra proteína con dos motivos homeodominio
En este caso, un heteodímero formado por una subunidad de la proteína anterior MAT alfa-2 y otra de una proteína similar, MAT A-1.