Motivo hélice-bucle-hélice

Dímero de la proteína Max de ratón, con dos motivos hélice-bucle-hélice idénticos, unido a un fragmento de DNA de 22 pb.

Cada cadena se muestra en un color: las 2 hebras de DNA y 2 motivos en la proteína dimérica.

La estructura que es común con otras proteínas, y por ello se llama motivo, consta de:

  1. un tramo en hélice alfa, que encaja en el surco mayor del DNA e interacciona directamente con las bases nitrogenadas (equivalente a la "hélice de reconocimiento" del motivo hélice-giro-hélice);
  2. un tramo de péptido sin estructura secundaria, más largo y flexible que en el motivo hélice-giro-hélice, llamado por ello un bucle, en inglés loop);
  3. otra hélice alfa que no interacciona con el DNA pero sí con la otra cadena proteica, estabilizando el dímero.

Estos tres componentes dan nombre al motivo. Además de ellos, cada proteína en particular posee otras regiones que forman el resto de la molécula, no mostradas.

Ejercicio:

Identifica cada parte de la molécula y señala el color con el que se ha representado en el modelo:
(haz clic sobre un recuadro coloreado para asignar ese color al elemento que queda a su derecha)
Hélice de reconocimiento
Bucle
Hélice de dimerización

Cuando acabes, pulsa

 

Modelo espacial compacto, o de esferas.

Otra proteína con dos motivos hélice-bucle-hélice

USF, proteína humana ("factor estimulador de secuencia arriba"), unido al DNA.
Obsérvese cómo la posición y dimensiones del bucle y de la segunda hélice son diferentes al ejemplo anterior.