Sentido del fujo de protones, orientación de la ATP sintasa y ubicación del ATP formado.
| mitocondria | cloroplasto | |
|---|---|---|
| A la vez que transportan los electrones, los complejos proteicos sacan protones de la matriz mitocondrial, hacia el espacio intermembranal. | bombeo de H+ | A la vez que transportan los electrones, los complejos proteicos sacan protones del estroma cloroplástico, hacia el espacio intratilacoidal. |
| Se acidifica el espacio intermembranal. | pH local | Se acidifica el lumen tilacoidal. |
| Dominio soluble F1 en el lado de la matriz (o estroma mitocondrial). | ATP sintasa | Dominio soluble CF1 en el lado del estroma. |
| Los protones regresan a la matriz, a través de la sintasa. | retorno de H+ | Los protones regresan al estroma, a través de la sintasa. |
| Se produce ATP en la matriz. | producción de ATP | Se produce ATP en el estroma. |