Simulación de electroforesis de proteínas en gel de poliacrilamida con SDS

Esta miniaplicación (applet) simula el proceso de electroforesis de las proteínas en un gel de poliacrilamida con SDS. Tras la separación, se puede obtener un gráfica con los resultados. En ésta, se determina la masa molecular experimental de las muestras a partir de su movilidad comparada con la de los patrones.

Instrucciones

Brevemente:

1. Elige una velocidad para la animación (depende de tu ordenador)
2. Elige una muestra (Problemas nº 1 a 10).
3. Elige la concentración de acrilamida en el gel (entre 7,5% y 15%).
4. Elige 2 o más patrones, marcando las casillas que hay junto a sus nombres. Puedes consultar su identidad y propiedades pulsando el botón Info. proteínas.
5. Elige un voltaje.
6. Pulsa el botón Añadir patrón para cargar los patrones en el primer pocillo.
7. Pulsa el botón Añadir muestra para cargar la muestra en el segundo pocillo.
8. Pulsa el botón Comenzar para conectar la corriente y comenzar la electroforesis. Antes de que las bandas se salgan por abajo, pulsa el botón Detener para pararla. 

Instrucciones detalladas (también pulsando en el botón Ayuda)

Definición de terminología (también pulsando en el botón Definiciones)

Análisis de resultados

1. Pulsando con el puntero del ratón sobre las bandas en el gel podrás ver arriba la información de cada una. Toma nota de la movilidad relativa de la banda de la muestra problema. Para estimar la masa molecular de la proteína problema:
2. Pulsa el botón Gráfica para mostrar la gráfica de calibrado.
3. En esa gráfica, mueve el puntero del ratón sobre el eje de abscisas; cuando el valor mostrado coincida con la movilidad de la proteína problema (anotada antes), pulsa el botón del ratón. Se trazará la interpolación y podrás leer junto al eje de ordenadas el valor del logaritmo de la masa molecular y en la parte superior esa masa.

Se buscan colaboradores:
para sacar partido a este simulador, sería interesante disponer de ejercicios o guiones que lo utilicen; también serán bienvenidos datos contrastados de otras proteínas.