Isoenzimas de la LDH:
¿cuál es la propiedad que permite su separación?
Carga de la proteína y punto isoeléctrico

Ambos polipéptidos, "A" o "M" y "B" o "H", son muy parecidos en su estructura, pero tienen algunas diferencias de secuencia:

Con fondo negro se marcan los residuos aminoácidos coincidentes; con fondo ocre, los aminoácidos similares; con fondo blanco, los diferentes.

Como consecuencia, sus propiedades fisicoquímicas son un poco diferentes, entre ellas su punto isoeléctrico y su carga eléctrica.

Puede observarse que la secuencia de la isoforma A tiene mayor número de residuos con carga positiva y la B más con carga negativa. Por ello, la carga de B será más negativa que la de A y los tetrámeros de LDH se moverán más rápido hacia el ánodo cuanto más subunidades B tengan.

Es decir, en orden de movilidad decreciente hacia el ánodo: B₄ > AB₃ > A₂B₂ > A₃B > A₄
que es lo mismo que H₄ > MH₃ > M₂H₂ > M₃H > M₄
o LDH-1 > LDH-2> LDH-3 > LDH-4

Para verificar esta deducción, a falta de una determinación experimental de los valores del punto isoeléctrico de cada isoforma, podemos acudir a la predicción computacional, basada en las propiedades conocidas de cada aminoácido cuando forma parte de una proteína:

• En el servidor de Expaxy, Compute pI/Mw:
  Código P00338 (LDHA_HUMAN) -> pI teórico: 8.5
  Código P07195 (LDHB_HUMAN) -> pI teórico: 5.7
• En el servidor Sequence Manipulation Suite, usando valores de EMBOSS:
  Código P00338 (LDHA_HUMAN) -> pI teórico: 8.5
  Código P07195 (LDHB_HUMAN) -> pI teórico: 5.9
  y usando valores de DTASelect:
  Código P00338 (LDHA_HUMAN) -> pI teórico: 8.3
  Código P07195 (LDHB_HUMAN) -> pI teórico: 6.1

Comprobamos así que B tiene menor pI, es más negativa que A para un mismo pH.

Angel Herráez. Parte de la sede web Biomodel.uah.es
Las secuencias se obtuvieron en UniProtKB; se calculó el alineamiento en T-Coffee y se representó usando BoxShade (ExPASy).