Problemas de Macromoléculas

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Problema 12: Secuencia de un polipéptido más largo

Un polipéptido de 10 aminoácidos de longitud se fragmenta en polipéptidos más pequeños y se determina la secuencia de varios de ellos. Entre los fragmentos identificados se encuentran los siguientes: Ala-Gly-Ser-Gln, Lys-Trp-Arg-Pro, Gln-His-Lys, Asp-Ala-Gly. ¿Cuál es la secuencia del polipéptido original?

- Guía de ayuda a la respuesta -

Composición de aminoácidos del polipéptido

Como ocurre en la cuestión anterior, una información importante es la longitud del polipéptido desconocido: 10 aminoácidos en este caso. ¿Cuáles son los 10 aminoácidos que componen el péptido desconocido? Lo averiguamos examinando las secuencias de los tres fragmentos que nos dan. Obsérvese que en esos tres fragmentos existen en total 10 aminoácidos diferentes. Éstos son, por orden alfabético:

Ala, Arg, Asp, Gly, Gln, His, Lys, Pro, Ser, Trp

Solapamiento de los fragmentos: Secuencia del pentapéptido

Dado que ninguno de los aminoácidos anteriores se encuentra duplicado, cualquier aminoácido que se encuentre en dos fragmentos a la vez identifica un solapamiento. Así, los cuatro fragmentos dados solapan de la manera siguiente:

ala-gly-ser-gln, lys-trp-arg-pro,
gln-his-lys, asp-ala-gly aligned as described in problem 11 resulting
in asp-ala-gly-ser-gln-his-lys-trp-arg-pro

Por lo tanto, el péptido original tendrá la secuencia:

Asp-Ala-Gly-Ser-Gln-His-Lys-Trp-Arg-Pro

The Biology Project
University of Arizona
Revised: January 30, 2003
En Español: Julio de 2004 (Universidad de Valencia)
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