Structura ADN – Plan de lecţie pentru profesori

• Adunati-va studenţii intr-un laborator dotat cu computere, în asa fel incat fiecare pereche de studenţi (sau fiecare studenţi) sa aiba în fata un computer. Este probabil mai bine ca studenţii sa lucreze în perechi.
• Intindeti-le cate o foaie de hartie cu intrebări. Spuneti-le studenţilor la ce intrebări doriti sa va raspunda şi cat timp au la dispozitie pentru asta. Daca lucreaza în perechi este probabil mai bine. Le puteti spune sa treaca la alte intrebări şi sa sara peste intrebările la care s-au blocat. Explicati-le ca se pot folosi de graficele moleculare interactive pentru a raspunde la intrebări.
• Dupa ce a trecut timpul stabilit, intindeti-le raspunsurile în asa fel incat o pereche sa aiba raspunsurile altei perechi şi invers. Incurajati discutiile intre grupuri.

Atentie:

La intrebărea 17 (din Setul B) se poate raspunde numai daca se utilizeaza unul dintre cele doua modele de ADN din acest tutorial. Autorul web sau instructorul pot decide care dintre cele doua modele este aratat, în functie de editarea fisierelor. Explicatie detaliata.

Raspunsurile la intrebări sunt disponibile unitatii de invatamant care face o cerere prin email domnului Eric Martz (în email trebuie sa se aduca o evidenta a pozitiei respectivei unitati de invatamant, cum ar fi un website în care sa fie listate unitatile de invatamant din aceeasi categorie – scoli, licee, universitati – sau website-ul respectivei unitati de invatamant).

[ înapoi la pagina de pornire ]

(Advansat)

Alegerea modelului de ADN

Doua modele alternative de ADN sunt oferite în acest tutorial. Puteti verifica ce model este folosit deschizand meniul pop-up din Jmol (click-dreapta, sau click pe logo-ul Jmol din coltul jos-dreapta) şi vedeti care este prima intrare de sus (va fi fie 1D66 sau dna).

(a) Clasicul 1d66-pwz.pdb (modificat de Eric Martz din 1d66.pdb, pentru vechiul tutorial ADN care foloseste Chime).

Acesta are o eroare în C28, a carui baza este rasucita în asa fel incat o alta parte este pusa fata în fata cu complementarul G11.

Folosind abilititatile Jmol , legaturile lungi de H sunt trase catre atomii corecti, în C28 şi G11, care sunt departe în model; legaturile de hidrogen rezultate, anormal de lungi, sunt similare cu cele trasate automat de Chime.

Martz s-a folosit de aceasta anomalie şi a propous astfel intrebărea #17 din setul de intrebări pentru studenţi.

(b) Un nou dna.pdb (modificat de catre Angel Herráez din 1d66-pwz.pdb) cu pozitia corectata a lui C28, care formeaza legaturi Watson-Crick de hidrogen normale în Jmol.

Intrebărea #17 nu are niciun inteles în acest model şi nu poate cere un raspuns.