Plán výuky pro DNA strukturu určený učitelům

Výuka může probíhat v počítačové učebně, kde každá dvojice studentů (nebo každý student) má počítač. Práce ve dvojicích je možná.
Rozdejte vytištěné otázky. Studentům řekněte na která čísla otázek chcete, aby se pokusili odpovědět a kolik mají času. Vysvětlete, že mají používat interaktivní struktury, které jim pomohou odpovědět na otázky. Pokud si studenti s některou otázkou nevědí rady, mohou ji vynechat.
Po vymezeném čase, rozdejte odpovědi a nechte každou dvojici ohodnotit odpovědi jiné dvojice. Podporujte diskuzi mezi skupinami.

Upozornění:

Otázka 17 (v rámci sady B) má svůj význam a lze na ni odpovědět pouze, pokud průvodce používá jeden ze dvou modelů DNA dostupných pro tento výukový program. Autor webu nebo instruktor může rozhodnout, který z nich se zobrazí, pomocí jednoduché editace jednoho ze souborů nebo návštěvou jiného serveru. Detailní vysvětlení.

Odpovědi na otázky jsou k dispozici učitelům, kteří pošlou e-mail Martinu Slavíkovi potvrzující zaměstnání ve škole například odkazem na web školy se seznamem zaměstanců.

Zpětná vazba . [

Zpět na hlavní stranu ]

(Pokročilé)

Výběr modelu DNA

Tento průvodce nabízí dva alternativní modely DNA. Můžete zkontrolovat, který z nich se používá, otevřením kontextové nabídky v Jmol (klikněte pravým tlačítkem nebo klikněte na logo Jmol v pravém dolním rohu apletu) a podívejte se na položku úplně nahoře, která bude buď1D66 nebo dna.

(a)Klasická struktura 1d66-pwz.pdb (upravená Ericem Martzem z 1d66.pdb, pro starý DNA tutoriál, který používal Chime).

Struktura má chybu v C28, jehož základna je převrácená tak, že špatná strana směřuje ke komplementárnímu G11.

Jmol zobrazí dlouhé H můstky přiřazené ke správným atomům v C28 a G11, i když jsou v modelu příliš daleko; výsledné, abnormálně dlouhé H můstky jsou podobné těm, které automaticky zobrazuje Chime.

Martz využil této anomálie k otázce #17.

Pro použití tohoto modelu, navštivte kopii průvodce na University of Massachusetts.

Pokud instalujete průvodce DNA na svůj vlastní server, použijte tento model: otevřete soubor utils.js pomocí editoru prostého textu a poblíž řádku 29 odstraňte dvě lomítka (//) před var DNAmodel = "1d66-pwz.pdb" a přidejte dvě lomítka před var DNAmodel = "dna.pdb". Uložte změny a obnovte stránku s průvodcem.

(b) Nová struktura dna.pdb (upravená Angelem Herráezem z 1d66-pwz.pdb) se správnou pozicí C28, vytváří v Jmolu normální Watson-Crickovy H můstky.

Otázka #17 nemá v tomto případě smysl a nemůže být zodpovězena.

Pro použití tohoto modelu, navštivte kopii průvodce na University of Alcalá.

Pokud instalujete průvodce DNA na svůj vlastní server, použijte tento model: otevřete soubor utils.js pomocí editoru prostého textu a poblíž řádku 29 přidejte dvě lomítka (//) před var DNAmodel = "1d66-pwz.pdb" a odstraňte dvě lomítka před var DNAmodel = "dna.pdb". Uložte změny a obnovte stránku s průvodcem.