21.6 Estructura del factor de terminación y analogía con la del tRNA

entre eRF y tRNA

de la molécula

Aunque la forma de ambas moléculas completas no es demasiado similar, las zonas clave de interacción con el ribosoma y con el RNA mensajero se encuentran en posiciones equivalentes:

• el extremo del “dominio 1” (N-terminal) del eRF,
  • en posición equivalente a la posición del anticodón del tRNA
  • y adecuada para contactar con el codón del mensajero
• el extremo del “dominio 2” (central) del eRF,
  • en posición equivalente a la del extremo del brazo portador del aminoácido en el tRNA
  • y que puede introducirse en el centro activo peptidil transferasa;
  • un residuo de glutamina propio de dicho extremo coordina la molécula de agua necesaria para conducir en dicho centro activo a la hidrólisis del enlace éster entre péptido y tRNA

(Además, la conformación de eRF cuando entra al ribosoma podría ser algo diferente a la que se muestra, que corresponde a la proteína cristalizada, y así asemejarse más aún a la del tRNA.)

Referencias:

• Estructura del factor de terminación de la traducción eRF1 humano (1DT9.pdb, difracción de rayos X) doi:10.2210/pdb1dt9/pdb
• Estructura del RNA transferente de la levadura Saccharomyces cerevisiae, específico para fenilalanina (4TNA.pdb, difracción de rayos X) doi:10.2210/pdb4tna/pdb