20.3 Estructura molecular de la interacción entre codones y anticodones

Para comenzar, se muestra sólo el del tRNAPhe:

Esqueleto (línea imaginaria que une los fosfatos).
Tallo (nucleótidos con bases emparejadas).
Bucle (nucleótidos con bases no emparejadas), que incluye el anticodón (triplete mG–A–A)
(mG es O2´-metilguanosina-5´-monofosfato)

Aquí se muestra el modelo molecular de la interacción de este anticodón (mG–A–A en el tRNA) con un codón U–U–U (en el mRNA).
Para diferenciarlos bien, se han coloreado los átomos de carbono del tRNA y los del mRNA.
 3  2  1
 tRNA   anticodón  3' -A-A-G- 5'
mRNA   codón 5' -U-U-U- 3'
 1  2  3

Obsérvense los enlaces de hidrógeno entre las bases de codón y anticodón, así como la coplanariedad y enfrentamiento de éstas.

Resaltar: A3U1
A2U2
G1U3

Notas:

Puesto que el metilo de mG está en la pentosa, no afecta a la formación de enlaces de hidrógeno y mG se empareja igual que G.

El codón complementario sería UUC, pero gracias al balanceo (pág. 315) también es posible el emparejamiento con UUU; a esto se le llama codones sinónimos, y ambos codifican Phe; una muestra de la degeneración del código genético.

Referencias: