Bucle D en el cromosoma mitocondrial
El bucle D (D-loop), asa de desplazamiento o asa de desdoblamiento es una región de la molécula de DNA mitocondrial (con 1112 nt) que
- presenta 3 hebras de DNA,
- contiene el origen de replicación de la hebra pesada [véase pág. 159 y web 11.13],
- contiene los orígenes de transcripción (promotores) de ambas hebras [véase pág. 272 y web 17.9],
- corresponde a la única región no codificante del mtDNA e incluye las regiones hipervariables I y II, en las que se ubica la mayor tasa de polimorfismos [véase pág. 412],
- aproximadamente en su centro se encuentra, por convenio, el origen de numeración para la secuencia de la molécula (nucleótido 1) [véase pág. 412].
El nombre procede de su aspecto al observarlo al microscopio electrónico:
Se forma este bucle cuando comienza la replicación de la hebra pesada; las 3 hebras no forman una triple hélice (pág. 55), sino que la nueva hebra H´ empareja con la L molde desplazando a la H.
Parte de esta misma región recibe el nombre de DNA 7S, una pequeña molécula de DNA monocatenario que se puede aislar junto con el cromosoma mitocondrial. Se trata precisamente del producto de una replicación interrumpida de la hebra pesada, que sólo ha recorrido la zona del bucle D y se ha detenido al alcanzar una cierta secuencia que señala la terminación de la replicación.