6.2 Emparejamientos de bases atípicos en los RNA

Se muestran algunos ejemplos, ilustrativos de la gran variedad de interacciones posibles.

Par UG, no canónico:
dos bases normalmente no complementarias, por tanto un emparejmiento distinto de Watson y Crick, “imperfecto”, menos fuerte que el canónico C≡G.

Par GC no canónico:
a pesar de ser bases complementarias de Watson y Crick, su interacción en este caso implica a grupos donadores y aceptores de hidrógeno diferentes:
N2H2···N3   y   N1H···O2
mientras que en el par de Watson y Crick serían
N2H2···O2   ,   N1H···N3   y   O6···H2N4 

Trío GGC:
un par canónico G≡C de Watson y Crick donde la guanina establece una intreacción adicional con otra G, por tanto un emparejmiento distinto de Watson y Crick, “imperfecto”, menos fuerte.
Trío UAA:
un par canónico U=A de Watson y Crick donde la adenina establece una intreacción adicional con otra A.

Trío AUrA
En este caso, un par UA no canónico al que se suma una interacción entre la ribosa de la uridina y otra adenina.

El emparejamiento entre U y A se establece entre
N3H···N7   y  O2···H2N6
mientras en un par de Watson y Crick sería
N3H···N1   y  O4···H2N6