5.10a Estructura de los motivos dedo de zinc

Simulación del plegamiento del motivo C₂H₂ en torno al zinc

La coloración de la cadena corresponde a la estructura secundaria que adquirirá al completar el plegamiento (hélice alfa, hebra beta, giro). Se resaltan los cuatro residuos (2 Cys, 2 His) que coordinarán al ion zinc.

Animación del plegamiento:

Puede apreciarse la fuerte dependencia de la coordinación del zinc para conseguir el plegamiento del motivo.

La secuencia es: -Ile-Cys-Val-Tyr-Val-Cys-His-Phe-Glu-Asn-Cys-Gly-Lys-Ala-Phe-Lys-Lys-His-Asn-Gln-Leu-Lys-Val-His-Gln-Phe-Ser-His-Thr-Gln-Gln-

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Referencias:

• La simulación tiene propósitos didácticos y no debe entenderse como la ruta real de plegamiento de la proteína. La estructura final es la del dedo nº 4 del factor de transcripción IIIA de Xenopus laevis, en complejo con el DNA (1TF6.pdb, doi:10.2210/pdb1tf6/pdb). El resto de conformaciones se calcularon desplegando dicha estructura experimental mediante dinámica molecular dirigida.
• Agradecimientos: J. I. Mendieta-Moreno y J. Mendieta (CBMSO y Biomol-Informatics, Madrid)