5.7 Estructura de los motivos hélice-giro-hélice

(HTH, helix-turn-helix)

Vemos aquí un dímero de la proteína del bacteriófago lambda llamada represor lambda, que posee un motivo HTH a través del cual se une al DNA en la región llamada operador (que regula la expresión de los genes del fago cuando éste infecta una bacteria).

Cada cadena se muestra en un color: las 2 hebras de DNA y 2 motivos en la  proteína dimérica.

la estructura que es común con otras proteínas, y por ello se llama motivo; éste consta de:

1. un tramo en hélice alfa, que encaja en el surco mayor del DNA e interacciona directamente con las bases nitrogenadas, llamado por ello hélice de reconocimiento;
2. un corto tramo de péptido doblado formando una horquilla rígida (un giro o vuelta, en inglés turn);
3. otra hélice alfa que queda más separada del DNA y forma un ángulo fijo con la primera, gracias a la rigidez del giro y a contactos entre las cadenas laterales de ambas hélices.

Ejercicio: tras los motivos, identifique cada parte de la molécula y señale el color con el que se ha representado en el modelo:

	Hélice de reconocimiento	(Pulse sobre un recuadro coloreado para asignar ese color al elemento descrito a su derecha) Cuando acabe, verifique sus respuestas
	Giro
	Segunda hélice alfa del motivo

Estos tres componentes dan nombre al motivo. Además de ellos, cada proteína en particular posee otras regiones en hélice alfa, giros y bucles que colaboran en la estructura del motivo, y el resto de la molécula de proteína, no mostrada.

El estrecho contacto entre proteína y DNA se aprecia mejor al el modelo con todos sus átomos en esferas.

Referencias:

• Estructura del represor lambda en complejo con el DNA operador del fago λ (1LMB.pdb) doi:10.2210/pdb1lmb/pdb