Conformaciones 2'-endo y 3'-endo de la pentosa
Estas dos posibilidades son la causa de la diferencia entre la doble hélice de tipo A y la de tipo B.Desoxirribosa en conformación 2'-endo.
Mueve el modelo y verifica que es el C2' el que está fuera del plano.
Si tienes problema para verlo:
Para ser 3'-endo, los coplanares deberían ser C1', C2', C4', O ; observa cómo se desvían mucho más de la coplanariedad y el 3' se sale menos del plano.
Esta es la conformación que da lugar a la doble hélice de tipo B (Watson y Crick). Pulsa para ver un par de nucleótidos. Pulsa para ver un tramo completo de B-DNA.
Desoxirribosa en conformación 3'-endo.
Mueve el modelo y verifica que es el C3' el que está fuera del plano.
Si tienes problema para verlo:
Para ser 2'-endo, los coplanares deberían ser C1', C3', C4', O ; observa cómo se desvían mucho más de la coplanariedad.
Esta es la conformación que da lugar a la doble hélice de tipo A. Pulsa para ver un par de nucleótidos. Pulsa para ver un tramo completo de A-DNA.
Ribosa en conformación 3'-endo.
Aquí se ve de nuevo muy claro que el C3' queda fuera del plano.
Para ser 2'-endo, los coplanares deberían ser C1', C3', C4', O ; observa cómo se desvían mucho más de la coplanariedad.
Esta conformación es la única compatible con la presencia del grupo OH en 3', por lo cual el RNA sólo adopta hélices de tipo A. Pulsa para ver un tramo completo de RNA.
Ribosa y desoxirribosa, ambas en conformación 3'-endo.
En un híbrido RNA:DNA, debido al requisito impuesto por la ribosa, ambas hebras adoptan la conformación de tipo A.
- C1', C2', C4', O
- C3'
- C1', C3', C4', O
(como antes, la coplanariedad es más perfecta en la ribosa que en la desoxirribosa)