El esqueleto peptídico gira formando una hélice y las cadenas laterales de los aminoácidos sobresalen hacia el exterior.
La hélice se ve mejor si representamos sólo una línea que une los carbonos alfa
Mostremos de nuevo los enlaces del esqueleto pero ocultando aún las cadenas laterales:.
La hélice está estabilizada por puentes de hidrógeno (••••••) entre los grupos carbonilo y los nitrógenos de los enlaces peptídicos.
Vista axial (desde un extremo). Observa que la hélice gira a derechas (es dextrógira o dextrorsa), como la rosca de un tornillo.
Mostrar las cadenas laterales.
Cada aminoácido de un color: Ser- Glu- Ala-Ala- Ile- Asn- Arg- Gln- Ile- Asn- Leu- Glu- Leu- Tyr- Ala
En los modelos de proteínas grandes, las regiones en conformación de hélice alfa se suelen representar de forma simplificada como una cinta en espiral , o bien como un cilindro .