RNA de transferencia

Los tRNA o RNA de transferencia son moléculas monocatenarias que adoptan un plegamiento o estructura tridimensional característica, en forma de L.
(La estructura secundaria que da lugar a este plegamiento o estructura terciaria es la llamada hoja de trébol)

Como se observa, existen unas regiones donde la molécula adopta una doble hélice intracatenaria. Esto ocurre gracias a la formación de puentes de hidrógeno entre bases complementarias de dos zonas de la misma cadena:

Mostrar/ocultar
grupo de bases n.º 1
grupo de bases n.º 2

Ejercicio:

¿Cuál de los dos grupos corresponde a bases emparejadas? 1 2
    

Estos enlaces hacen que se adopte el plegamiento tridimensional, dándole a la molécula su estructura tridimensional característica.

Las zonas emparejadas definen cuatro brazos o asas en la estructura del tRNA; ordenados de 5' a 3' son:

colorear así los brazos

Cada brazo (excepto el aceptor del aminoácido) tiene una región emparejada, o tallo (stem), y otra no emparejada en su extremo, o bucle (loop).

(puedes usar los botones de más arriba para ver y ocultar las bases)

Además de los 4 brazos, existe otra región, de longitud variable, que puede o no emparejar sus bases: el brazo variable .


Vistas axiales a lo largo de los dos brazos de la "L":

sobre el eje del brazo aceptor (con el extremo 3' en primer plano, y el 5' un poco más atrás)

sobre el eje del brazo del anticodón (con el anticodón en primer plano)


Sobre el modelo espacial compacto veamos algunas zonas funcionalmente importantes de la molécula.

Ejercicio:

Identifica cada parte de la molécula y señala el color con el que se ha representado en el modelo:
(haz clic sobre un recuadro coloreado para asignar ese color al elemento que queda a su derecha)
Esqueleto
Bases
  Nucleótido del extremo 5':
Esqueleto
Base
  Nucleótido del extremo 3':
Esqueleto
Base
  Anticodón:
Esqueleto
Base

Cuando acabes, pulsa

 


Volvamos a la representación simplificada. El ejemplo que hemos visto corresponde al tRNA de levadura específico para fenilalanina (tRNAPhe).
Veamos otro ejemplo, en el cual el brazo variable (trazado más grueso) es mayor: (tRNASer de levadura).
(sobre esta molécula los botones de ocultar y mostrar bases no actuarán correctamente)