Ángulos diedros (ϕ y ψ) en las proteínas y la representación gráfica de Ramachandran

Estructura Gráfica de Ramachandran
ϕ = fi   ψ = psi
Mientras se arrastra en la gráfica, restringir a:
O bien escribe unos valores:
ϕ = ψ =
Rotación de la estructura cambiando un ángulo:
Resaltar: (no funcionan durante la rotación)

(impedimento estérico)

ϕψ

(arrastra el punto morado por la gráfica)
ϕ
ψ

Leyenda para la gráfica de Ramachandran:

  • ━━━ límite de conformaciones bastante estables (favorecidas)
  • ━ ━ límite de conformaciones moderadamente estables (permitidas)
  • α hélice alfa (a derechas, la habitual)
  • Lα hélice alfa a izquierdas (infrecuente)
  • 310 hélice 3(10)
  • β hebra beta, hoja o lámina beta
  • poly P hélice de poliprolina (también hélice del colágeno)

Para una descripción más completa de las características y el significado de esta gráfica, así como ejemplos en proteínas completas, puedes visitar la página Ramachandran Plot en Proteopedia (en inglés).

Una página equivalente a ésta (en inglés) se aloja en Proteopedia: Tutorial:Ramachandran Plot Inspection

Nota: a falta de una abreviatura normalizada de una letra para la hidroxiprolina, aquí se usa Π en la secuencia.

La imagen de las áreas en la gráfica de Ramachandran es una modificación a partir de “Ramachandran_plot_original_outlines” por Dcrjsr [licencia CC-BY]

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