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Nomenclatura y abreviaturas de bases, nucleósidos y nucleótidos

De acuerdo con la normativa de IUPAC e IUBMB.

Con identidad conocida

  : bases infrecuentes

base:

adenina

Ade

guanina

Gua

citosina

Cyt

timina

Thy

uracilo

Ura

uracilo

Ura

xantina

Xan

hipoxantina

Hyp

orotato

Oro

tiouracilo

Sur

fluorouracilo

FUra

bromouracilo

BrUra

tiohipoxantina

Shy

nicotinamida

 

nucleósido:

adenosina

Ado

guanosina

Guo

citidina

Cyd

ribosiltimina

Thd

uridina

Urd

pseudouridina

Ψrd

xantosina

Xao

inosina

Ino

orotidina

Ord

tiouridina

Srd

fluorouridina

FUrd

bromouridina

BrUrd

tioinosina

Sno

ribosilnicotinamida

Nir

desoxiadenosina

dAdo

desoxiguanosina

dGuo

desoxicitidina

dCyd

timidina

dThd

           

fluorodesoxiuridina

FdUrd

bromodesoxiuridina

BrdUrd

   
nucleótido:

adenilato

AMP

guanilato

GMP

citidilato

CMP

ribotimidilato

TMP

uridilato

UMP

                 

desoxiadenilato

dAMP

desoxiguanilato

dGMP

desoxicitidilato

dCMP

timidilato

dTMP

 

 

                 
residuo (*): A G C T U Ψ X I O S        

*) Residuo de nucleótido formando parte de un ácido nucleico.

Los desoxirribonucleósidos se indican con una 'd' delante de la abreviatura.
Para los ribonucleósidos se puede anteponer una 'r' si se quiere resaltar su naturaleza.

Otros nucleótidos:

Con ambigüedad

Estas abreviaturas se usan particularmente en secuencias de ácido nucleico.

  no identificada purínica pirimidínica
base: Base Pur Pyr
nucleósido: Nuc Puo Pyd
nucleótido: NMP    
residuo: N R Y

  G o C A o T G o T A o C C, G o T A, G o T A, C o T A, C o G
residuo: S W K M B D H V
enlace fuerte,
Strong
enlace débil,
Weak
oxobases,
Keto
aminobases,
aMino
no es A;
siguiente letra
no es C;
siguiente letra
no es G;
siguiente letra
no es T;
siguiente letra

 

Bibliografía: