Terminología relacionada con la electroforesis

Acrilamida: El principal monómero constituyente de la poliacrilamida.
Agarosa: Un polímero que forma un gel con poros grandes. Se usa como medio separador para realizar electroforesis de macromoléculas, en especial ácidos nucleicos.
Agentes reductores
: Compuestos químicos capaces de reducir los enlaces disulfuro de las proteínas (-S-S-) a grupos sulfhidrilo (-SH). Permiten desplegar completamente una proteína y separar las subunidades de una proteína multimérica; ambos efectos son necesarios para que la movilidad de la proteína en una electroforesis SDS-PAGE sea acorde con su masa molecular. Los más habituales con el beta-mercaptoetanol y el ditiotreitol (DTT).
Ánodo: Electrodo positivo (al que se dirigen los aniones, de carga negativa).
Bisacrilamida: Nombre común de la N,N'-metilenobis(acrilamida), un monómero constituyente de la poliacrilamida.
Cátodo: Electrodo negativo (al que se dirigen los cationes, de carga positiva).
Corrientes de convección: .
Desnaturalizante: Un compuesto químico o una condición física que provocan desnaturalización de las macromoléculas.
Ditiotreitol: treo-2,3-dihidroxi-1,4-butanoditiol. También llamado reactivo de Cleland.
Véase agentes reductores.
Reacción de reducción de disulfuros:
Dodecilsulfato sódico: Compuesto con propiedades detergentes, empleado habitualmente en electroforesis (técnica SDS-PAGE) por su capacidad de desnaturalizar las proteínas y de unirse a ellas en una proporción masa/masa constante. Como resultado, las moléculas de proteína quedan completamente desplegadas y recubiertas de una carga negativa uniforme, y por ello su movilidad electroforética es inversamente proporcional a su número de aminoácidos.
Otros nombres: SDS, laurilsulfato sódico.
DTT: Ditiotreitol.
Electroforesis: Separación de moléculas en disolución mediante aplicación de un campo eléctrico. Dependiendo del soporte empleado, las moléculas se separarán en función de una combinación de su carga eléctrica, su tamaño y su forma.
Electroforesis capilar: .
Estructura cuaternaria: .
Estructura primaria: .
Estructura secundaria: .
Estructura terciaria: .
Flujo electroosmótico: .
Flujo electroforético: .
Mercaptoetanol: Más correctamente, beta-mercaptoetanol o 2-mercaptoetanol. Véase agentes reductores.
Masa molecular: La masa de una molécula. Habitualmente se indica sin unidades, referida a la unidad de masa atómica (u.m.a. o dalton, Da), por lo que es más correcto llamarla masa molecular relativa (M_r). El término peso molecular es menos correcto. En el caso de macromoléculas, particularmente proteínas, es frecuente el uso de la masa molecular dividida por mil, expresada entonces como kilodáltones (kDa). Finalmente, la cantidad de sustancia cuya masa en gramos es numéricamente igual a M_r corresponde a un mol de la sustancia.
Ejemplos:
La masa molecular del sulfato de cobre anhidro (CuSO₄) es 159,6 uma = 159,6 Da, o bien su masa molecular relativa es M_r = 159,6. Su masa molar es 159,6 g/mol
La masa molecular de la mioglobina es 17183 Da = 17,2 kDa; su masa molecular relativa es M_r = 17183. Su masa molar es 17183 g/mol
Migración relativa: .
Nativo: .
Ovillo aleatorio: .
Poliacrilamida: Polímero generado a partir de acrilamida y bisacrilamida. Forma un gel con poros más pequeños que la agarosa. Se usa como medio separador para realizar electroforesis de macromoléculas, en especial proteínas y fragmentos de ácidos nucleicos.
Rm: (Relative Mobility) Movilidad relativa. Véase migración relativa.
SDS: (Sodium Dodecyl Sulphate) Dodecilsulfato sódico.
SDS-PAGE: (Sodium Dodecyl Sulphate - PolyAcrylamide Gel Electrophoresis) Electroforesis en gel de poliacrilamida en presencia de SDS. El detergente SDS se incluye en la composición del gel y en el tampón de electroforesis, habitualmente en una concentración del 1%. La principal utilidad de esta técnica es la estimación de la masa molecular de proteínas.
Subunidades: .
Tampón: .

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