Ejercicio 4.5

El modelo corresponde a un dipéptido.
  1. ¿Cuál es su secuencia?
    Empleando abreviaturas de tres letras: –
    y con abreviaturas de una letra: –
  2. Identifica los átomos que forman parte del enlace peptídico. Comprueba que son coplanares moviendo el modelo.
    Para marcar los átomos:
    1) el marcado
    2) pica con el ratón sobre los átomos elegidos (puedes quitar la marca picando de nuevo)
    3) tu respuesta 
   
a)
La secuencia comienza por el aminoácido N-terminal, es decir, aquél cuyo grupo amino alfa está libre, no enlazado. En este caso, se trata de la serina. El otro aminoácido, C-terminal, con su grupo carboxilo alfa libre, es la alanina. La secuencia, por tanto, es Ser-Ala o S-A (nunca Ala-Ser, que sería otra molécula químicamente distinta).
[ Nótese que en este modelo los grupos amino y carboxilo están en forma -NH2 y -COOH, forma que nunca se da en disolución (a pH neutro sería -NH3+ y -COO- ) ]

b)
El enlace peptídico lo forman seis átomos:
Calfa,  C y O carbonílicos de Ser, N y H del amino de Ala y Calfa de ésta
Puedes verificar cuáles son estos átomos en el propio modelo pulsando