Código genético

¿Dónde aparece la representación circular?

La figura de arriba, creada para nuestras clases y luego incorporada en el libro citado, es una ampliación de la idea básica encontrada en la portada de la revista Biochemical Education, donde no se indicaba su origen ni su autor.
   Nos parece que esta forma de representación es mucho más manejable que la tradicional tabla rectangular y, en consecuencia, intentamos promocionarla como forma estándar de representación del código genético.

   En un intento de averiguar los orígenes y la difusión de esta idea, he encontrado algunas páginas en internet (búsqueda en Google para "circular" + "genetic code", 18 nov.03).

  • Biochemical Education (Pergamon Press, Elsevier), vol.23, iss.3, july 1995
  • La representación circular se remonta al año 1972: Bresch, C. & Hausmann, R. Der genetische code. In: Klassische und Molekulare Genetik. Bresch, C., Hausmann, R. (eds.), Springer, Berlin, pp. 243–278.
 
  • Se utiliza en el libro Biology, de Miller y Levine (Prentice Hall), donde promueven su uso por razones didácticas:
    http://www.millerandlevine.com/images/Circular-Code.gif
    http://www.millerandlevine.com/guide/DNA-seq-problem.pdf#page=2
Otras son, aparentemente, copias del mismo esquema:
    • http://chemistry.mtu.edu/~mthomps/ch4710/gencode.html
    • Curso BIOLOGY - The Living Science en Brown University (Providence, RI, USA):
      http://biocrs.biomed.brown.edu/Books/Chapters/Ch%208/Ch8-teachers.html
      http://biocrs.biomed.brown.edu/Books/Chapters/Ch%208/Code-Table-circular.ht
      http://biocrs.biomed.brown.edu/Elephant%20stuff/Chapters/Ch%207/Code-Table-circular.ht
  • En Helix Bioinformatics (un grupo de investigación del INRIA, instituto nacional francés de investigación en informática y automática, en Grenoble y Lyon) añaden el uso de un color para cada base:
    http://www-helix.inrialpes.fr/article478.html
    http://www-helix.inrialpes.fr/projects/ISee/Traduction1.htm
  • En Institut de Génétique Humaine de Montpellier tienen una versión similar (© Protein Cybernetics), pero además es un mapa sensible, es decir, pulsando sobre las distintas zonas se obtiene la fórmula estructural y varias propiedades de cada aminoácido.
    http://acrux.igh.cnrs.fr/proteomics/codon.html
  • El National Centre for Biotechnology Education publicó en 2000 (disponible en papel y por internet) la colección "Practical protocols", en la cual un capítulo titulado "Illuminating DNA" incluye un diagrama circular (sin citar autoría).
    http://www.ncbe.reading.ac.uk/NCBE/PROTOCOLS/DNA/PDF/DNA01.pdf
    Un artículo posterior, con ocasión del cincuentenario del modelo de Watson y Crick, repite el diagrama:
    Cut-out 3-D model of DNA:
    http://www.ncbe.reading.ac.uk/DNA50/cutout.html
    http://www.ncbe.reading.ac.uk/DNA50/PDF/Cutouts.pdf

 


  • Beltramini et al. (2006) Biochemistry and Molecular Biology Education 34 (3), 187-193. Incluido en el artículo reproduciendo un material de estudio, el "disco de aminoácidos".
  • En 2008, un producto promocional de Roche ha consistido en un reloj de pulsera cuya esfera reproduce un código genético circular.


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