1.- Introducción

Objetivos

• Introducción al uso de recursos informáticos de identificación y visualización de moléculas en 3D.
• Aplicación para la preparación de materiales de apoyo docente, en forma de presentaciones interactivas o de páginas web.
• Adecuación a las necesidades e intereses de los asistentes al curso.

Utilidades

Archivos de ejemplo para practicar (pulsa con el botón derecho y elige "guardar enlace como..." o "guardar destino como...")

• paquete completo (zip)
• naftaleno (.cif)
• biotina (.sdf) ; biotina (.mol2) ; biotina (.cif)
• cisteína (.pdb)
• lisozima (.pdb)
• cristal: barita (.pdb) ; caolinita (.mol)
• celda unidad: mica (.cif) ; biotina (.cif) ; (piridina-N)-mercurio(II) dicromato(VI) (.cif)
• animación multi-modelo: reacción S_N1 (.cml)
• vibración: acetileno + HBr (.log Gaussian)
• orbitales moleculares: H₂SO₄ (.log Gaussian)
• complejo enzima-sustrato (citrato sintasa con citrato y un derivado de CoA):
  • monómero
  • dímero

Colección de archivos de prueba de Jmol: web

Web de Jmol (información general, formatos, ejemplos, descarga): jmol.org

Wiki de Jmol (información más concreta, ayudas, listado de recursos): wiki.jmol.org

Cómo utilizar Jmol para estudiar y presentar estructuras moleculares. A. Herráez (2007) Lulu Enterprises: Morrisville, NC, USA. 144pp. ISBN 978-1-84753-710-2
+ Supplement 2011.